Online Documentation for SQL Manager for MySQL
Форматтер SQL
Средства задания настроек автоматического форматирования SQL запросов расположены на вкладке SQL Formatter.
SQL Formatter также используется при форматировании SQL скриптов и в редакторах некоторых объектов.
На вкладке Settings задайте, какие части запроса следует форматировать автоматически.
Установив флажки 
Format SQL query и Format subquery, Вы включаете автоматическое форматирование запросов и подзапросов.
Смотрите также:
