Online Documentation for SQL Manager for MySQL
Как сравнить две БД
Вы можете сравнить и синхронизировать структуры двух баз данных с помощью Мастера сравнения баз данных. Мастер позволяет выявить различия и применить соотвтествующий скрипт для внесения изменений.
Запустить мастер можно из главного меню:
Tools | Compare Databases...